Se sabe que los guaraníes habrían llegado a territorio misionero en aluviones ocupacionales aproximadamente en el año 1000, desplazando de manera forzosa, o aculturando, a diversos grupos de caingangs y guayanás.

Estos últimos se vieron forzados a desplazarse a las zonas selváticas en los casos en que no sucumbieron ante la violencia guaraní, que ocupó las zonas de campos, márgenes de ríos y de arroyos.

Ubicado al SurEste del Departamento de Apóstoles, entre la localidad de Azara y el Departamento de Concepción de la Sierra, este pequeño Municipio de unos 120 Km2 fue creado oficialmente como Comisión de Fomento por resolución Nº 43 de fecha 13 de Enero de 1949, en el entonces Territorio Nacional, bajo el gobierno de Aparicio Almeida, y en él predominan los minifundios.

La primera Comisión de Fomento fue creada por Decreto 408 del 24 de mayo de 1949, y sus integrantes fueron: Juan Draganczuk, Wladimiro Knatiuk, Pablo Kubichin, Demetrio Zbihley y León Zdanowicz.

Un acceso mejorado y entoscado de 5 Km. conectada a la localidad con la ruta provincial 105, cuyo asfalto a su vez la vincula a la red vial provincial y nacional. Hasta la planta urbana también se puede acceder a través de las rutas provinciales Nº 2 Y NQ 202, mejoradas. Esta localidad, sin una fecha de asentamiento inicia!, pero con una colonización que data de los últimos años del siglo pasado, debe su nombre a la derivación de un vocablo de origen brasileño cuya traducción al castellano significa: TRES MOGOTES. El gobierno de facto en el año 1977 intentó castellanizar la denominación, pero la practicidad y la costumbre de los pobladores continuaron llamándole TRES CAPONES. Y es así como hasta la actualidad continúa. Los primeros contingentes de inmigrantes fueron originarios de Ucrania y por ello el Santo Patrono de la localidad es San Vladimiro, el Grande, cuya festividad se celebra todos los 15 de Julio.
Este aferrarse a su original nombre da la pauta de que los pobladores del Municipio son muy conservadores en lo que hace a lo cultural y a sus costumbres religiosas. El Club Social de la localidad fundado en la década del `30, hoy deteriorado, en su edificio alberga viejas historias del apogeo cultural de los años `40 década esta en la que la colonia manifestó su mayor prosperidad. ",

El principal atractivo turístico del lugar lo constituye el edificio de la Iglesia Católica Apostólica Ortodoxa que con sus cúpulas y naves ofrece inusuales características arquitectónicas que datan de 1902 y en la que se destaca excepcionalmente una enorme campana de la que existen solo tres en todo el mundo: Una en Moscú (Rusia), otra en Toronto (Canadá) y la tercera en Tres Capones (Misiones).

Los Organismos Públicos y de Servicios asentados en el Municipio son: 1 Destacamento Policial dependiente de la Comisaría de Azara, 2 puestos de Salud, uno en la zona urbana y otro en el Paraje "Las Tunas" y la Estafeta Postal se opera en el mismo edificio Municipal. El Santo Patrono de Tres Capones es San Vladimiro El Grande, cuya festividad se celebra todos los 15 de junio. 

FUENTE MISIONES, MI TIERRA ROJA